使用R包ABSOLUTE基于拷贝数变异

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使用R包ABSOLUTE基于拷贝数变异（CNV）估算肿瘤纯度

这是年末的时候在工作中接触的一个分析。公司的某客户提供了一批肿瘤样本的体细胞拷贝数变异（CNV）数据，期望能通过生物信息学的方法，基于CNV信息估计这批肿瘤样本的纯度。

不过我当时刚接触肿瘤基因组不久，相关知识了解不多。方法选择中，主要参考了李岚等（）的文献资料（如下部分截图），最终使用R程序包ABSOLUTE进行了对肿瘤纯度的估算。

本篇简单梳理了ABSOLUTE的使用。

使用ABSOLUTE估算肿瘤纯度

更多关于ABSOLUTE的详细背景、工作原理、流程简介等，可参阅官方文档（

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